我国现有的企业金融服务体系主要由以银行为主导的间接融资和以证券市场为主导的直接融资构成，但中小微企业目前还无法将此两种方式作为主要融资渠道。
在直接融资方面，股票市场和债券市场的进入门槛较高，中小微企业较难进入。我国股票市场主要扶持国有大中型企业上市融资，对发行上市设定了较高的门槛，在孵企业是初创的新兴企业，与公司法规定的上市条件相差甚远。与股票市场相类似，中小微企业也较难进入债券市场。因此，在孵企业要利用发行股票和债券作为主要融资手段基本还不现实。
在间接融资方面，在孵企业获得的资金非常有限。在我国间接融资体系中，商业银行贷款占较大比重，但是中小微企业获得商业贷款存在障碍。银行出于控制风险的考虑，贷款主要集中于大中企业，向中小微创业企业提供的贷款规模较小。
总得来看，在孵企业融资渠道不通畅，从商业银行和资本市场获得资金的难度都较大，由此导致了中小微企业的资金主要来源于非正规的融资渠道。另一方面也造成间接融资和直接融资相比银行贷款为主的间接融资比重较高。
